Дорогие друзья!
Это мини-отчёт по глобальной чистке номенклатуры проекта "Флора России".
Список видов проекта (утилита от @kildor доступна по адресу https://kildor.name/inat/species) общим объемом 7568 названий был выгружен в четверг 30 сентября 2021 г. Самые наблюдательные из вас заметили, что спустя четыре дня (3 октября 2021 г.) число видов на счётчике сократилось до 7538 штук. Подробности этого цикла чистки даны ниже.
Выгруженный список мы прогнали через блок стыковки номенклатуры, который встроен в Цифровой гербарий МГУ (https://plant.depo.msu.ru/). Встроенный модуль с помощью sql-запросов запрашивает данные через api внешних баз, что позволяет: (1) исключить из дальнейшей ручной проверки аккуратно вставшие уникальные названия (таких оказалось 6650 штук, или 88%); (2) найти дублирующие названия и неточности орфографии; (3) проверить список гибридов; (4) отметить виды, которые в других источниках могут считаться таксономическими синонимами.
Задача первого этапа: найти номенклатурные синонимы (т.е. основанные на одном типе), которые в iNaturalist случайно считаются разными видами. Как правило, у таких видов совпадает конечный эпитет. Всего обнаружено 27 таких случаев дублирования, для каждого проставлены флаги. И это только те случаи, по которым было дублирование наблюдений по флоре России под двумя названиями. Важно: чтобы не зависеть от скорости решения флагов кураторами (иногда на это уходит годы), наблюдения из дублирующих таксонов были переопределены с примечанием "Чистка" (см., например, https://www.inaturalist.org/observations/20413698).
Впрочем, XX объединений уже произведены кураторами:
Bilacunaria microcarpa
Hippomarathrum microcarpum
Jacobaea erucifolia argunensis
Senecio argunensis
Elymus elongatus
Thinopyrum elongatum
Parasenecio auriculata
Parasenecio auriculatus
Petasites sibiricus
Endocellion sibiricum
Potentilla inquinans
Drymocallis inquinans
Ranunculus sarmentosus
Halerpestes sarmentosa
Eritrichium rupestre
Amblynotus rupestris
Podospermum laciniatum
Scorzonera laciniata
Hemerocallis middendorffii
Hemerocallis middendorfii
Limoniopsis overinii
Limoniopsis owerinii
Vincetoxicum purpureum
Cynanchum purpureum
Tephroseris hyperborealis
Packera hyperborealis
Nitrosalsola laricina
Caroxylon laricinum
Malva transcaucasica
Malvalthaea transcaucasica
Scabiosa olgae
Lomelosia olgae
Peucedanum baicalense
Kitagawia baicalensis
Peucedanum terebinthaceum
Kitagawia terebinthacea
Cerastium dubium
Dichodon viscidum
Helictotrichon compressum
Helictochloa compressa
Helictotrichon hookeri
Helictochloa hookeri
Ещё 6 случаев пока в очереди. Комментарии к флагам от знающих людей приветствуются:
https://www.inaturalist.org/flags/545917 Physocaulis nodosus
Chaerophyllum nodosum
DRAFTED https://www.inaturalist.org/taxon_changes/72684 Arctanthemum arcticum
Chrysanthemum arcticum
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546470 Saccharum ravennae
Tripidium ravennae
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546468 Bassia hirsuta
Spirobassia hirsuta
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546490 Alyssum murale
Odontarrhena muralis
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546491 Arabidopsis gemmifera
Arabidopsis halleri gemmifera
Задача второго этапа: проверить таксоны гибридного происхождения, обозначить как гибриды те бинарные названия, которые в базе iNaturalist помечены просто как виды. Такие изменения оформляется как "taxonomic swap" со сменой номера таксона.
https://www.inaturalist.org/flags/546603 Papaver tuberculatum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/499479 Nuphar spenneriana
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546598 Spiraea rosalba
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546599 Spiraea pallidiflora
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546600 Gaillardia grandiflora
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546604 Potentilla angarensis
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546605 Rosa majorugosa
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546606 Rubus idaeoides
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546607 Symphyotrichum salignum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546608 Symphyotrichum versicolor
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546609 Veronica sessiliflora
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546610 Viola contempta
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546611 Viola incissecta
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546612 Viola ruprechtiana
Задача третьего этапа (работа продолжается): исправление родовой принадлежности случайных потеряшек. Как правило, по этим родам были большие таксономические передвижки, но некоторые виды случайно потерялись и остались в старых родах. Пока задокументировано 24 таких случая:
https://www.inaturalist.org/flags/546514 Elymus mucronatus
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546591 Salsola ericoides
https://www.inaturalist.org/flags/546594 Scorzonera ikonnikovii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546595 Senecio racemosa
https://www.inaturalist.org/flags/510357 Crepis nana
https://www.inaturalist.org/flags/512616 Schizophragma hydrangeoides
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/515542 Potamogeton filiformis
https://www.inaturalist.org/flags/546626 Colpodium variegatum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546627 Hystrix coreana
https://www.inaturalist.org/flags/546629 Laserpitium stevenii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546630 Scabiosa austroaltaica
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546630 Scabiosa gumbetica
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546630 Scabiosa isetensis
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia aizoides
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia imbricata
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia laricina
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia biebersteinii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia helmii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546633 Stipa alpina
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546633 Stipa mongholica
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546634 Podospermum laciniatum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546634 Podospermum meyeri
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546634 Podospermum purpureum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546636 Angelica sachokiana
Ещё 19 случаев переносов отдельных видов между родами выявлены, но не разрешены, поскольку по ним пока нет консенсуса (например, Lactuca s.l., Crepis s.l., некоторые группы Brassicaceae и проч.). Для двух Polygonum s.l. (Aconogonon) в принятом на iNat роде Koenigia нет опубликованных комбинаций.
Кроме того, некоторое количество изменений запрошены в POWO (это необходимо, поскольку кураторы iNaturalist используют POWO как внешний таксономический хребет):
Исправить в POWO:
1) Anemonoides glabrata should be in Anemonastrum (at least as a synonym)
2) Anemone ochotensis should be in Anemonoides (at least as a synonym)
3) Lycopodium subarcticum should be in Spinulum (at least as a synonym)
4) Lycopodium dubium should be in Spinulum (at least as a synonym)
5) Conioselinum vaginatum and Conioselinum tataricum are always treated as synonyms (both accepted in POWO)
6) Silene repens Patrin and Silene amoena L. are always treated as synonyms (both accepted in POWO)
7) Artemisia viridis Willd. ex DC. (Artemisia rupestris subsp. viridis) is usually accepted
8) Carex ensifolia is a frequently used name, absent in POWO (C. bigelowii group)
9) Alhagi pseudalhagi is a frequently used name, absent in POWO (A. maurorum group)
10) Delphinium cultorum is a frequently used name for garden plants, absent in POWO
11) Malva erecta is a frequently used name, absent in POWO (a synonym of Malva sylvestris L.)
Добавить в POWO и IPNI:
1) Astragalus charadzeae absent in POWO & IPNI
2) Astragalus gulemiensis absent in POWO & IPNI
3) Lactuca abietina absent in POWO & IPNI (a name for Prenathes abietina in Lactuca)
4) Parasenecio tschonoskii absent in POWO & IPNI
Трудные случаи:
1) Ribes maximoviczianum Kom. was published to replace the illegitimate name Ribes maximoviczii Kom. IPNI records should be crosslinked (https://www.ipni.org/n/77205172-1 and https://www.ipni.org/n/792836-1) and the POWO record should be updated.
2) to extract Allium praescissum Rchb. from synonymy of A. paniculatum. This is an easternmost member of the section Codonoprasum growing on saline ground from Volga to Altai (some pics are available here: https://www.plantarium.ru/page/view/item/2127.html for A. praescissum and https://www.plantarium.ru/page/view/item/2110.html for the rest of A. paniculatum).
На следующих этапах планируется сверка таксономических синонимов (основанных на разных типах) и исправление неточной орфографии у некоторых названий в случае необходимости. Это зависит от того, насколько удачным будет опыт первых этапов.
Пожалуйста, пишите в комментариях к этому посту любые накопившиеся вопросы по номенклатуре (в идеале каждый вопрос - один комментарий, чтобы их можно было удалять по мере решения). Особенно интересны случаи очевидного дублирования принятых названий, но не только они.