🌳🍊 Мы продолжаем наш образовательный канал на YouTube "Осины с Апельсином"! Здесь мы размещаем наши краткие видео-уроки (от 15 до 30 минут) по разным разделам ботаники. Морфология, фитоценология, география растений и другие. Автор цикла - Ксения Дудова (@antennaria).
🌱🌱🌱 Можно ли открыть новый вид растений для науки в 2023 году? На какие регионы стоит обратить внимание в поисках новых видов, и может ли любитель природы без профессионального образования первым заметить неизвестный науке вид? Обо всех этих моментах мы говорим в новом выпуске канала «Осины с Апельсином».
В эфире снова новости компьютерного зрения. Напомним, что в восьмой модели автоматического распознавания видов, которая была запущена 19 августа 2022 г., были второй раз использованы новые критерии отбора видов для обучающего датасета: теперь минимальный порог равен не ста наблюдениям, а ста фотографиям. Осенью 2022 г. был анонсирован новый алгоритм добавления видов в модель автоматического распознавания: примерно раз в месяц те виды, которые добрались до квалификационного порога, добавляются в модель без пересчёта включенных ранее видов. Это позволило заметно ускорить включение новых растений. Новая модель (v2.2, т.е. вторая ежемесячная порция обновлений грандиозной второй модели) основана на данных, выгруженных из системы 19 февраля 2023 г. - в ней появилось 398 новых видов растений, в т.ч. 43 вида проекта "Флора России".
После этого дополнения модели, мы быстро сделали чистку "Копилки флоры России". Оказалось, что с 20 января сразу 41 из 300 видов копилки стали известны системе, и она их предлагает пользователям при определении снимков (в скобках число наблюдений этих видов из всех стран на iNaturalist):
Даже сам по себе этот факт примечательный - вдумайтесь, каждый месяц ещё несколько десятков видов флоры России становятся известными моделям компьютерного зрения iNaturalist. В большинстве регионов свыше 95% загружаемых фотографий (в Средней России 99%) относится к таким видам, которые известны системе, а, значит, чем лучше и правильнее пользователь фотографирует объект, тем больше шансов, что он сразу получит верный ответ. Тут скорее может подвести пространственная неполнота данных или сезонные дырки в наблюдениях. Не забывайте, что параметр "увиденные поблизости" учитывает как географическую близость (квадрат 3 на 3 градуса), так и сезонность (интервал 3 месяца - текущий и два соседних). Собственно, по этой причине модель вам не предложит новозеландских эндемиков в Подмосковье или подснежников осенью.
Так что если вам действительно важно быстро узнать, что это за растение, не дожидаясь отклика экспертов, неторопливо делайте аккуратные снимки с разных ракурсов и обязательно перечитайте пост "Как снимать, что снимать: учимся у классиков. Особенно это будет актуально летом, когда возможности экспертного сообщества на порядок ниже потока свежих летних фотографий.
Итак, после обновления копилки наш список снова включает 300 видов (правда, теперь гораздо более редких). После выхода обновлений мы будем регулярно менять виды, преодолевшие этот порог, на те, что находятся ниже по списку.
Кроме того, в связи с коррекцией номенклатуры и активной работы экспертов в копилке появилось несколько видов с большим числом наблюдений, для которых модель будет пересчитана с нуля:
1) Ждём выхода новой модели и релиза в блоге iNaturalist по этому поводу.
2) Берем полный список видов проекта "Флора России".
3) Скриптом проверяем, какие виды не включены в текущую модель компьютерного зрения.
4) Убираем из "Копилки" виды, попавшие в текущую модель.
5) Берем топ-300 видов по числу наблюдений проекта "Флора России" (в этот раз порог 34 наблюдения).
6) Добавляем ВСЕ их наблюдения с фото из всех стран в копилку - для обучения используются в т.ч. наблюдения, сделанные в культуре.
7) Делаем новые наблюдения этих видов, загружаем их на сайт, проверяем определения.
8) См. пункт 1.
КАК МОЖНО ПОМОЧЬ?
НОВЫЕ ГАДЖЕТЫ. Для ряда видов имеется недостаточное разнообразие устройств: напрямую в релизах iNaturalist об этом не говорится, но Алекс Шепард в комментариях к постам рассказал, что наложены дополнительные ограничения на разнообразие источников, из которых поступают фотографии. При выгрузке обучающего набора фотографий из их метаданных берутся сведения, на какие устройства был снят тот или иной вид. К сожалению, точные значения пороговых отметок при этом не обнародованы. Если небольшое разнообразие устройств и наблюдателей не позволяет сделать обучающую выборку репрезентативной, то такой вид оставляется в сторонке для дальнейшего накопления данных. Такие ограничения вводятся потому, что, как показал эмпирический опыт, при обучении модель становится сильно зависимой от типа и марки устройств, на которые производилась съемка и, например, может узнавать какой-то вид, снятый на айфонах, но не видеть его на прочих фотографиях.
НОВЫЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ. Несмотря на преодоление пороговых отметок, многие виды пока не включены в модель. Почему? У части видов пока недостаточная доля наблюдений исследовательского уровня (особенно у видов с большим числом наблюдений из-за рубежа, а также в сложных группах типа Alchemilla, Thymus, Carex и т.п.). Так что без участия экспертов в определении фото видов-кандидатов совершенствование модели компьютерного зрения невозможно в принципе. Например, большое число видов флоры Приморья не включены в модель из-за большого числа неподтверждённых наблюдений из Южной Кореи.
НОВЫЕ ФОТО. Цель копилки - максимально ускорить процесс сбора фотографий по видам, которым чуть-чуть не хватает для включения в модель автоматического распознавания видов. Эти фото будут использованы в следующем обучающем наборе. Все мы замечаем, что каждый раз модель становится всё более компетентной и редко допускает грубые ошибки. Участники целенаправленно пополняют копилку, ориентируясь как на список видов (добавляя региональные фильтры), так и на карту, по которой мы можем глянуть на ближайшие точки видов-кандидатов и постараться сделать дополнительные наблюдения именно этих видов. Поверьте: такие поиски даже в соседнем лесу могут превратиться в увлекательное приключение! Но не забывайте, что из каждого наблюдения на обучение модели пойдёт только 5 фотографий (для соответствия критерию по разнообразию гаджетов).
Вот все формальные пороги для новых видов:
ранг вида (гибриды, подвиды и разновидности не включаются)
минимум 100 фото
50% фото имеют определение сообщества
не более 5 фото из одного наблюдения
Иными словами, по текущим правилам, всего 20 исключительно полных наблюдений "исследовательского уровня" достаточно для включения нового вида в модель.
РЕЗУЛЬТАТ. Именно первое включение вида в модель основано на наиболее чистом датасете фотонаблюдений, поскольку эти изображения вручную определены экспертами и наблюдателями (без учета мнения модели). Затем неизбежно начинают накапливаться ошибки, основанные на использовании подсказок, и обучение следующей модели хотя бы частично становится основанным на автоматически определенных фотографиях. Впрочем, обучающий массив при этом неизбежно растёт.
Не забудьте ознакомиться с текущими новостями в конце поста - там снова несколько обновлений.
На счётчике сегодня новая круглая отсечка: 2 410 000 наблюдений в проекте "Флора России"! Для очередных 10 тыс. наблюдений нашему сообществу потребовалось всего 4 дня (в прошлый раз на 10 тысяч ушло 8 дней). За последние 4 дня число наблюдателей флоры России выросло на 30 новичков, а число выявленных и подтверждённых видов выросло на 7 таксонов в условиях активной чистки номенклатуры. В середине февраля мы преодолели отметку в 8000 видов.
We've got another milestone on the counter - 2,410,000 observations in the "Flora of Russia" project! For the 10-thousandth mark, our community spent 4 days (comparing to 8 days for previous 10K). During these days, the number of observers of the flora of Russia increased by 30 folks. We've got seven new identified and confirmed species in line with an active cleaning of nomenclature. We passed the milestone of 8,000 species in mid-February.
За последние 4 суток сразу 201 человек из 21,7 тыс. наблюдателей смогли выйти на улицу, сделать хотя бы одно наблюдение в природе и загрузить его на iNaturalist. В этот раз доля свежих полевых наблюдений составила 12% (против 88%, поступивших из архивов пользователей или вытащенных экспертами из бэклога). Несмотря на наступление весны, большинство наблюдений всё же пока идут из архивов.
Over the past 4 days, 201 people have been able to go outside, make at least a single observation in nature and upload it to iNaturalist. This time, the share of fresh field observations was 12% versus 88% that came from archives or pulled by the experts from the backlog.
Давайте снова зафиксируем статистику для истории.
2 410 000 наблюдений наш проект достиг 2 апреля 2023 г. в 16:28 MSK.
The project reached 2,410,000 observations in April 2, 2023 at 16:28 MSK.
С прошлого замера проект вырос на 9,9 тыс. наблюдений, а антипроект сократился сразу на 3,4 тыс. наблюдений. На сегодняшний день доля неопределенных материалов по флоре России упала до 13,28% (в прошлый раз было 13,43%). Мы ежегодно отмечаем сокращение завалов примерно до конца апреля. Так что пока продолжается то время, когда стоит загружать летние и прошлогодние архивы! Судя по статистике, именно архивы сейчас питают наш проект. Интересно, что мы уже заметно преодолели прошлогодний минимум бэклога (13,44%) и уверенно продолжаем целенаправленно сокращать завалы.
Как и прежде мы благодарны всем, кто ставит галочку "В культуре" для снятых культивируемых растений. Пожалуйста, прочитайте специальный релиз, посвященный загрузке 100 000-го наблюдения культурной флоры России. На днях мы преодолели отсечку в 150 000!
2) Региональные проекты "Флоры России" очень разные по числу наблюдений, участников и подписчиков. Собственно, именно они в сумме и составляют данные основного проекта. На главной странице зонтичного проекта можно посмотреть региональный зачёт по числу фотонаблюдений, видов и наблюдателей.
3) Антипроект (бэклог) "Флоры России" включает неопределённые и неверифицированные наблюдения и является важнейшей точкой входа для наших экспертов. Бэклог составляет свыше 420 000 наблюдений после активного сезона, но с осени постепенно сдувается. Это обычный ход вещей: как правило, число наблюдений в нём сокращается с сентября по апрель и растёт в тёплое время года.
4) Большая "Флора России" включает как определённые, так и неверифицированные наблюдения. Она нужна для оценки общего состояния данных по флоре России, загруженных пользователями. Например, здесь удобно смотреть, какова доля неопределенных наблюдений. Это плоский проект без региональной структуры.
5) "Серая зона" включает наблюдения культурных растений и забракованные данные, т.е. наблюдения, не отвечающие формальным критериям качества. Мы благодарны всем, кто ставит галочку "Культурное" для снятых культивируемых растений.
6) Потеряшки "Флоры России" - это такой небольшой проект, который включает около 300-500 определённых и верифицированных наблюдений, которые случайно не попали в региональные порталы. Это происходит из-за: (1) слишком большого радиуса привязки наблюдений, (2) несовершенства шейп-файлов регионов, (3) намеренного искажения или загрубления координат или радиусов, (4) привязки к административным единицам, а не к конкретным точкам.
7) И, наконец, у нас есть копилка "Флоры России". Её история такова: ещё в 2021 г. вышла очередная новая модель автоматического распознавания видов iNaturalist. Для того, чтобы привлечь внимание сообщества к видам, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель, мы и запустили копилку. В ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. Виды в копилке постоянно обновляются - мы исключаем из неё виды, преодолевшие пороговую отметку и добавляем новые.
Приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону". В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения.
Традиционные таблички даны ниже.
1. Самые активные участники (число наблюдений) | Top-observers (number of observations)
● В конце апреля нас ждёт City Nature Challenge. Все подробности здесь. Кто хочет привезти CNC в свой город - становитесь админами городских проектов! Всё просто: хотите большой движухи? Конкурсы, соревнования, биоблицы? Командный кубок? Личный кубок? Белые пятна? Пройдите наш опрос. Форма для опроса будет доступна до 15 апреля.
● Лекторий "Флоры России" - главное событие этой весны! Вас ждёт 16 лекций от ведущих ботаников страны. Лекции проходят онлайн по пятницам или субботам. Обязательно приходите на прямые эфиры! На этой неделе нас ждёт уже девятая лекция. А здесь наш канал в YouTube, на который обязательно стоит подписаться!
● Научно-популярный канал "Осины с апельсином" - это короткие ведеоистории по ключевым ботаническим вопросам для участников проекта "Флора России". Автор цикла - Ксения Дудова (@antennaria). Обязательно подписывайтесь на наш апельсиновый канал в YouTube. Восемь видео готово, ждём новые! Еще у нас есть полноценные лекции для новичков iNaturalist на нашем канале "Полевая биология для небиолога".
● Снова вышла новая модель автоматического распознавания видов. Теперь модель дополняется новыми видами ежемесячно! Мы снова обновили копилку "Флоры России" - в ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. Присоединяйтесь! Каждая модель становится всё более и более компетентной. Все подробности здесь?: и про отбор видов, и про личное участие в обучении моделей.
● Опубликованы очередные истории из цикла "Перераспределение усилий" 2023 года. Мы охватили 37 регионов и дошли до Красноярского края (здесь же есть все ссылки на публикации цикла). Автор карт - Ярослав Магазов (@yaroslavmagazov). Двигаемся согласно рейтингу, и до вашего региона тоже доберемся - всему своё время!
● Опубликован второй релиз карт "Атласа флоры России". Мы подробно рассказали об этом важном событии. Каждая сеточная карта по квадратам 100×100 км на 8793 видов сделана на основе датасета FLORUS. Работа над чисткой карт продолжается.
● Цифровой гербарий МГУ запустил большую новую платформу для онлайн-волонтёров помогатор. Онлайн-лекция о Гербарии МГУ и помогаторе доступна в записи.
● Проект "Флора России" на iNaturalist теперь официально зарегистрирован на платформе dobro.ru в качестве волонтёрского проекта. Это платформа, на которой ведётся учёт российских волонтёрских инициатив, в том числе программ научного волонтёрства. Пожалуйста, подпишитесь на нас на этой странице, используя учётку с Госуслуг. Это будет очень полезно для дальнейшей спокойной работы iNaturalist в России.
Для написания данного поста использован конвертер текстовых и табличных данных, который осуществляет разметку текста. Конвертер разработал Константин Романов (@kildor). Если у вас есть свои проекты, то вам эта ссылка, уверен, пригодится!
Это традиционный пост-напоминалка перед началом нового полевого сезона. Все, кто тэгнут в этом посте, для своих наблюдений выбрали такие настройки лицензий, что их данные не идут в GBIF. Мы искренне просим участников iNaturalist удостовериться, что у вас выставлена открытая лицензия (для этого подходят ТОЛЬКО лицензии CC0, CC-BY, CC-BY-NC). Другие типы лицензий не подходят. Если у вас не проставлена лицензия, то в карточке каждого наблюдения у вас в правом нижнем углу написано "Все права защищены", если проставлена, то, как правило, - "Некоторые права защищены".
Для того, чтобы ваши данные попадали в GBIF, в "Настройках учётной записи" нужно перейти в раздел "Контент и отображение" (подраздел "Лицензирование"). Там вы в выпадающем списке выбираете отдельно лицензии для наблюдений, фото и аудио и обязательно ставите галочку "Обновить существующие фото новыми вариантами лицензий". Спустя пару недель все ваши наблюдения исследовательского уровня отправятся в GBIF.
Отдельный выбор лицензий для фото и для самих наблюдений позволяет, например, продвинутым фотографам блокировать жёсткими настройками изображения, но, при этом, направлять метаданные наблюдений (что, где и кем снято) в GBIF.
Ниже перечислены наиболее активные пользователи по флоре России (загрузки 2023 года), которые пока не перешли на лицензии CC0, CC-BY, CC-BY-NC для своих фотонаблюдений, а потому их данные не идут в GBIF (а, значит, и в "Атлас флоры России"):
Это подборка видео А.П. Серегина (МГУ). Публичные лекции, онлайн-выступления, доклады на конференциях, университетские курсы, телевизионные новостные сюжеты, записи радио-подкастов. Пост будет обновляться и дополняться. Все записи размещены в хронологическом порядке от свежих к старым.
Здесь собраны только записи с открытых ресурсов. Курс по географии растений (флора мира), который был прочитан в АРХЭ весной 2023 года, лежит в платном доступе (подробности https://arhe.msk.ru/?p=120820, для получения доступа напишите на arhe.msk@gmail.com).
По вопросам организации отдельных лекций, лекционных курсов и приглашённых докладов на конференциях пишите на почту botanik.seregin@gmail.com .
2024 ГОД
"Гербарные коллекции + Алтай". Лекция состоялась на биологическом факультете МГУ 2 октября 2024 года. Вторая лекция межфакультетского курса МГУ "Флора мира: истории из экспедиций". Читает доктор биологических наук Алексей Петрович Серегин. Каждая лекция состоит из двух частей: первые 45 минут будут посвящены отдельным вопросам курса, а вторые 45 минут – живому рассказу об экспедициях автора. В конце лекций студенты выбирают, о какой экспедиции пойдёт речь в следующий раз. Часть 1. Что такое гербарный образец? Какую информацию он несет? История гербарных коллекций. Современный обзор гербарных коллекций. Типовые образцы как основа ботанической номенклатуры. Мировые пропорции и диспропорции. Утраты. Современные тренды. Часть 2. Ботаническая поездка в Центральный Алтай летом 2008 года. Алтай – один из четырех хотспотов флористического разнообразия России (для региональных флор). Сегодня просто слушаем истории из дневника экспедиции. Ссылка на курс МФК: https://lk.msu.ru/course/view?id=3462
"Что такое география растений + Канарские острова". Лекция состоялась на биологическом факультете МГУ 25 сентября 2024 года. Первая лекция межфакультетского курса МГУ "Флора мира: истории из экспедиций". Читает доктор биологических наук Алексей Петрович Серегин. Каждая лекция состоит из двух частей: первые 45 минут будут посвящены отдельным вопросам курса, а вторые 45 минут – живому рассказу об экспедициях автора. В конце лекций студенты выбирают, о какой экспедиции пойдёт речь в следующий раз. Часть 1. Знакомство. Введение в географию растений. Краткая история. Основные разделы: классические и современные. Основные источники. Основные методы. Обзор мирового разнообразия растений. Обзор основных закономерностей. Видовое богатство – от бедных флор к богатым флорам. Пределы жизни растений. Флористическое районирование. Самые интересные места на ботанической карте земного шара. Часть 2. Канарские острова. Эти острова развивались изолировано. Уникальная флора Канарских островов имеет не менее уникальную историю. Рассмотрим, как они заселялись растениями, какие были основные вехи эволюции и что представляет природа Канарских островов сегодня. Ссылка на курс МФК: https://lk.msu.ru/course/view?id=3462
Лекция «Атлас флоры России» состоялась 24 сентября 2024 г. на площадке МИСИС в рамках всероссийской акции Лекторий «10 лет с РНФ». Тема - подведение итогов проекта «Атлас флоры России: система документации и анализа пространственного разнообразия растений» (https://istina.msu.ru/projects/367012376/), поддержанного грантом РНФ.
Проект "Флора Москвы" (в Цифровом гербарии МГУ и на iNaturalist) (старт доклада А.П. Серегина в точке 5:16:47). Московский предпринимательский форум (Технопарк МГУ, кластер "Ломоносов", 23 мая 2024 г.). Москва реализует экологическую стратегию города, благодаря чему бизнес внедряет лучшие практики зеленого строительства, экостройки без шума и пыли, отказ от дизельного топлива и т.д. В рамках сессии представители города расскажут про то, какие есть запросы на технологии, и про возможности, которые дает город экологичным проектам.
Лекция состоялась в научно-популярном лектории центра "Архэ"(http://arhe.msk.ru) 6 февраля 2024 года. Ежегодно ботаники находят и описывают около 2000-2500 новых видов сосудистых растений по всему земному шару. Эта цифра стабильна уже около 20 лет, и 2023 год не стал исключением. Иногда открытие (ботаники говорят «описание») нового вида – это результат длительной кропотливой работы в труднодоступных местностях, крупнейших гербарных коллекциях мира и лабораторных исследований последовательностей ДНК. А иногда – результат случайного фотоснимка, сделанного на курорте. За каждым открытым видом тянется по-своему интересная история, и сделать выбор, о чём рассказать по итогам года, непросто. Как и во времена Карла Линнея, каждый новый вид ботаники описывают по гербарным образцам, а, значит, коллекции сухих растений постоянно продолжают пополняться новинками.
2023 ГОД
Большие данные о разнообразии растений России (21.09.2023). На Х Съезд Общества физиологов растений России, который проходит в Уфе, мы пригласили прочитать научно-популярную лекцию Алексея Серегина, д. б. н., сотрудника МГУ имени М.В. Ломоносова и куратора Гербария МГУ. Ученый расскажет и про Цифровой гербарий МГУ, и про iNaturalist, и про оцифровку литературы.
iNaturalist в России: как мы учим компьютер узнавать растения по фото (17.09.2023). День Биолога, МГУ. Компьютерное зрение как часть технологий искусственного интеллекта сделало возможным распознавание живых организмов по изображениям. Можете себе такое представить? Ещё двадцать с лишним лет назад вдохновлённые люди рассказывали о том, что развитие молекулярных методов приведёт к тому, что в руках учёного будет устройство размером с пульт от телевизора, в него можно будет положить кусочек листика, и машина с точностью сможет определить вид этого растения. Сейчас прогресс дошёл до того, что нужно просто взять смартфон, навести камеру на растение, сфотографировать его, и мы получим, причём с очень большой долей надёжности, ответ на вопрос, что это такое. Так что, во-первых, прогресс неизбежен. А, во-вторых, он непредсказуем. Об этом и будет вести речь А.П. на своей лекции.
АРХЭ. 9 сентября 2023 г. прошла первая лекция Лектория «Флоры России». Флористические находки – это то, с чем неизбежно сталкивается в результате своей работы любой ботаник. Они бывают долгожданными и неожиданными, выстраданными и случайными, одиночными и массовыми, новыми и повторными, понятными и запутанными, региональными и локальными. Флористическим находкам посвящены специальные разделы ботанических журналов. Но любая флористическая находка – это целая история, о которой интересно рассказать. Ведь, прежде всего, это истории о растениях. Вас ждут рассказы о растениях Москвы и Мещёры, Черноземья и Севера, Урала и Путорана, Байкала и Приморья, Крыма и Кавказа, которые были найдены автором при различных обстоятельствах. Будут истории о важности гербарных коллекций и современных методах документации флоры.
АРХЭ. 3 сентября 2023 г.: короткое видеоприглашение посмотреть лекции осеннего семестра нашего Лектория. Лекторий «Флоры России» — это еженедельный онлайн-семинар проекта Московского университета «Флора России» на iNaturalist, где приглашенные лекторы выступают с обзорными лекциями. Мы приглашаем выступать учёных, которые, как правило, являются активными участниками iNaturalist. Лекции охватывают широкий круг вопросов ботаники и смежных дисциплин с особым вниманием к вопросам ботанической географии, систематики, морфологии и охраны природы.
Документальный фильм про Н.М. Альбова. Моё участие небольшое, но фильм получился замечательным! Съемки на биофаке шли 31.05.2023. Итак, двадцать восьмая передача проекта "Имя. Символ33" посвящена путешественнику, ботанику, первооткрывателю флоры Абхазии Николаю Михайловичу Альбову. Этот ученый открыл сотни новых растений; наносил на карты озера и ледники; сохранял легенды тех мест, где ему доводилось бывать. Жизнь его была коротка, но необычайна наполнена: Альбов родился в России, всем сердцем любил Кавказ, а умер в Южной Америке , почти сразу после того, как им был составлен гербарий флоры южного края земли — архипелага Огненная Земля.
11 февраля 2023 г. мы провели первую встречу в рамках большого цикла научно-популярных лекций, которые пройдут до конца мая. Первую вводную лекцию «Что мы знаем о флоре России» прочел организатор проекта, ведущий научный сотрудник гербария МГУ, д. б. н. Алексей Петрович Серегин. Он рассказал о том, как оценивается общее разнообразие флоры страны. Мы поговорили как о региональных особенностях и их причинах, так и об общих закономерностях. И, конечно же, о вкладе ученых и волонтеров в наши современные знания о флоре России. Следить за анонсами проекта и лектория и записаться на них можно в этих сообществе Цифровой гербарий МГУ (https://vk.com/mw_herbarium). Лекторий организован Гербарием Московского государственного университета, а по своей сути является частью проекта «Флора России». *Цель проекта — создать цифровую базу данных по биоразнообразию сосудистых растений, которая станет самой большой в России. К сосудистым растениям относятся все высшие растения за исключением мохообразных. В базу данных войдут также сведения о динамике распространения видов, этапах их сезонного развития и экспансии заносных видов.
АРХЭ. 7 февраля 2023 г. Лекция Алексея Серегина "Что такое география растений?" курса "География растений: флора мира". 📢 Знакомство. Введение в географию растений. Краткая история. Основные разделы: классические и современные. Основные источники. Основные методы. Обзор мирового разнообразия растений. Обзор основных закономерностей. Видовое богатство – от бедных флор к богатым флорам. Пределы жизни растений. Флористическое районирование. Самые интересные места на ботанической карте земного шара. 📢 Обзорный курс по общей географии растений от ведущего научного сотрудника биофака МГУ А.П. Серегина. Методы современной географии растений сильно изменилась за последние годы благодаря накоплению больших данных о биоразнообразии. Тем не менее, круг исследовательских задач остался тем же: выявление закономерностей размещения растений на поверхности Земли. Объектом географии растений могут быть как сами растения, которые мы характеризуем через географическое пространство, а, с другой стороны, объектом является и сама территория, которой мы даем характеристику с помощью набора видов и растительных сообществ. Будут также истории про дальние страны и отдельные интересные растения. 🔎 Лектор - Серегин Алексей Петрович, ведущий научный сотрудник биофака МГУ, доктор биологических наук.
АРХЭ. Приглашение на курс Алексея Серегина в АРХЭ "География растений: флора мира"
Коллекции Гербария МГУ (А.П. Серегин, онлайн-лекция), 03.02.2023. С вечера четверга (2 февраля 2023 г.) портал Цифрового гербария МГУ был закрыт на несколько дней для больших технических работ на серверном оборудовании. Был недоступен как сам портал, так и помогатор. Это была прекрасная возможность рассказать в прямом эфире о Гербарии Московского университета. Коротко о сюжетах: Что такое гербарий? Гербарии мира. Коллекции Гербария МГУ. Основные коллекторы. Как росла коллекция. География сборов. Цифровой гербарий МГУ. Помогатор. Как стать волонтёром Гербария МГУ? В конце была вопросно-ответная сессия и анонс ближайших платных и бесплатных лекций в рамках проекта "Флора России" и курса "География растений" в АРХЭ.
"Флора России" на iNaturalist: интерактив с экспертами (А.П. Серегин, apseregin), 13.01.2023. Во время эфира А.П. просто определял растения на iNaturalist и что-то при этом рассказывал. В общем, это интерактивная лекция, из которой вы узнаете как правильно снимать разные группы растений и как работают эксперты проекта "Флора России" на iNaturalist (https://flora.depo.msu.ru/ ). Обязательно садитесь за компьютер, чтобы было видно детали наблюдений. Если формат окажется удачным, участников будет много, а вопросы будут интересны для всех, то можно будет сделать онлайн-встречи с экспертами регулярными.
В Цифровом гербарии МГУ собрали более 1 млн растений со всего мира TV BRICS, 14.01.2023. Цифровой гербарий МГУ – самая крупная в России база данных растений. Ученые Московского университета отсканировали и опубликовали более миллиона образцов со всего мира. «Мы сейчас цифруем только то, что к нам поступает. Ежегодно это 15–16 тысяч образцов, иногда 20 тысяч. Кроме того, мы на платформе цифрового гербария МГУ фактически создали консорциум российских гербариев», – сообщил Алексей Серегин, ведущий научный сотрудник биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, научный руководитель проекта «Цифровой гербарий». Гербарий Московского университета создается уже более 200 лет. Оцифровка коллекции растений обеспечит ее сохранность в будущем и сделает базу данных доступной для любого человека.
ANI News Official (18 Jan 2023). The Moscow State University’s digital herbarium is the largest plant database in Russia. Scientists at Moscow University have scanned and published more than a million specimens from around the world. The Moscow State University (MSU) herbarium is more than 200 years old. Digitization of the plant collection will ensure its preservation in the future and make the database accessible to anyone. With the digital herbarium, the user can find out not only the species of plant, but also where, by whom and when the specimen was collected. Volunteers find plants, send specimens and their photos and collect information for the database. In four years of such work, 21,000 participants have prepared 2.3 million photos of plants all over Russia. The MSU Digital Herbarium is also an interaction platform. The help of volunteers in creating the database allows scientists to free themselves from routine work and citizens to feel like botanists.
2022 ГОД
"Флора России на iNaturalist" (Алексей Серёгин, 14.12.2022). Обзор проекта. Площадка: Информационная встреча натуралистов, любителей природы и научных работников, посвященная проектам гражданской науки в Казахстане, в первую очередь, платформе iNaturalist ("Возможности iNaturalist для изучения живой природы Казахстана"). Презентации и полезные ссылки (откройте папку на гугл-диске и скачайте): http://bit.ly/3HBMhfe .
Это десятое видео из цикла Школы гражданской науки (конец мая 2022 года). Алексей Серегин, куратор проекта "Флора России", д.б.н., ведущий научный сотрудник кафедры экологии и географии растений МГУ имени М.В. Ломоносова, расскажет о том, зачем использовать платформу iNaturalist, как взаимодействовать с волонтерами и в чем секрет успеха Флоры России.
Брифинг, посвященный началу Кубка-2022. 28 мая 2022 стартует соревнование для любителей растений "Кубок Флоры России 2022". Это отличная возможность узнать новое о природе и помочь науке своими наблюдениями. В небольшой лекции Алексей Петрович Серегин, доктор биологических наук (каф. экологии и географии растений МГУ имени М.В. Ломоносова) рассказал о том, как ранее проводили соревнования кубка проекта "Флоры России", об изменениях в регламенте и, собственно, о новых правилах участия.
Фитоинвазии, пленарные доклады (февраль 2022 г.). Проект «Флора России» на iNaturalist как источник данных о распространении, расселении и видовом составе адвентивной флоры страны. Серегин Алексей Петрович.
2021 ГОД
«Хотспоты флоры России». Спикер: Алексей Петрович Серёгин (24.08.2021). Хотспотами в современной биогеографии называют места с исключительно высоким биоразнообразием. Россия находится за пределами тропических областей Земли, поэтому ее флора не отличается богатством. Однако и в нашей стране есть уголки, заслуживающие внимания как профессиональных ботаников, так и натуралистов. Из лекции узнаем, куда стоит поехать, чтобы увидеть почти 25% биологического разнообразия растений России.
«Цифровое биоразнообразие». Спикер: Алексей Петрович Серёгин (26.08.2021). Будущее «превратит интернет в гигантскую глобальную информационную систему о биоразнообразии», — так в 2000 году охарактеризовал возможности информатики биоразнообразия один из авторов журнала Science. Стремительное развитие технологий позволяет документировать биологическое разнообразие с невиданной ранее интенсивностью и эффективностью. Из лекции узнаем, почему современная биогеография уже невозможна без анализа больших данных.
Атлас флоры России (Ломоносовские чтения - 2021). Общий мировой тренд - работа с большими данными. Но прежде чем начать с этими данными работать их нужно каким-то образом собрать. Данные о распространении отдельных видов собирает крупнейшая база данных по биоразнообразию GBIF. Данные из России в этой базе данных являются основой создания Атласа Флоры России. При этом большая часть данных из России попала туда благодаря проектам, которые так или иначе ведет А. П. Серегин и его команда.
В своем докладе Алексей Петрович расскажет о том из каких "кирпичиков" складывается Атлас Флоры России, какие датасеты из России представлены в GBIF, как происходит сбор этих данных , какие проблемы существуют и какие перспективы у этого проекта есть.
АРХЭ. Лекция состоялась 28 февраля 2021 года в рамках лектория центра "АРХЭ" (https://arhe.msk.ru/) на фестивале "Первозданная Россия" (https://fotocult.ru/). Сколько видов во флоре России? Точного ответа на этот вопрос нет – вероятно, не менее 12 500 видов. Архивная революция затронула и ботанику: классические труды и гербарные коллекции стремительно переходят в цифровой формат и уже сейчас находятся в открытом доступе. Активные полевые исследования учёных продолжаются, а новые технологии дают возможность всем желающим принять участие в документации растительного разнообразия нашей страны с помощью смартфонов. Лектор: Серегин Алексей Петрович, доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник биологического факультета МГУ, лауреат премии РГО 2018 г.
2020 ГОД
[Начало на 6:32:00]
АРХЭ. "Твоя экспедиция в твоём смартфоне (проект "Флора России" на iNaturalist)" (А.П. Серегин). В проекте "Флора России" на iNaturalist свыше 10 тыс. участников, и почти каждый из них сделал в этом году хотя бы одно фотонаблюдение в природе и загрузил его на наш портал. Считается, что это самый большой проект в стране в области научного волонтёрства. И, что здорово, он связан с полевыми наблюдениями. Команда экспертов проекта (МГУ и другие учреждения) каждый день отслеживает поступающие материалы и уточняет видовую принадлежность растений. За 22 месяца проекта участники сделали 850 тыс. определенных наблюдений 7000 видов флоры России, еще 126 тыс. наблюдений пока не определены. Любой активный участник проекта может рассказать о своих путешествиях и коротких вылазках в соседний лес. Из таких историй складывается ежедневная жизнь проекта "Флора России". За два года Алексей Серегин загрузил на платформу iNaturalist 34 тыс. наблюдений и сделал 60 тыс. наблюдений. В полевом сезоне 2020 года Алексей поработал в 21 субъекте РФ, в т.ч. в экспедиции Russian Travel Geek в Забайкальском крае (хребет Кодар). На своем примере наш спикер расскажет об участии ученых в проекте "Флора России" как в команде натуралистов-наблюдателей, так и в команде экспертов.
Доклад А.П. Серёгина "Цифровой гербарий МГУ: через региональные сайты к консорциуму" (5.10.2020). Дистанционная видеопрезентация на конференции в Екатеринбурге. Запись произведена в МГУ 3.10.2020. Автор видео Д.В. Сухова.
Проект “Флора России” на международной платформе iNaturalist объединил профессиональных ученых и любителей природы со всей страны. В сборе данных участвует свыше 7000 человек. За полтора года участники собрали свыше 530 000 фотонаблюдений по 7000 видам флоры России. Это самый большой по объему массив открытых пространственных данных о биоразнообразии растений страны, ведущий источник данных по современному состоянию флоры. Все данные проекта находятся в открытом доступе и могут свободно использоваться в научной, поисковой и природоохранной деятельности. О жизни проекта расскажет ведущий научный сотрудник МГУ, доктор биологических наук Алексей Серегин.
2019 ГОД
О проекте “Флора России” в iNaturalist (Алексей Серегин). Презентация в рамках Семинара "Естественнонаучные коллекции Югры", 25-26 марта 2019, Ханты-Мансийск (доклад сделан во время дружеского ужина).
Семинар по GBIF: Серегин А.П., Вступительное слово. Семинар Естественнонаучные коллекции Югры, Ханты-Мансийск, 25-26 марта 2019 «Естественнонаучные коллекции Югры: сбор, фиксация, хранение, введение в научный оборот», Ханты-Мансийск, 25-26 марта 2019.
9 февраля 2019 г. в Москве, в Центральном доме художника, на VI фестивале Первозданная Россия, в 12.30, выступил ведущий научный сотрудник биологического факультета МГУ Алексей Серегин. Рассказ о проекте «Цифровой гербарий МГУ» — крупнейшей в России базе данных по биоразнообразию. Цифровой гербарий — портал с изображениями и метаданными почти всех видов флоры России и сопредельных стран. Колоссальная информационная база, интегрированная с аналогичными международными платформами. Результат работы более ста человек, позволивший России стать одним из мировых лидеров в области информатики биоразнообразия. А недавно в фонды гербария включили миллионный образец. И все это богатство — в свободном доступе. Принять участие в создании «Атласа флоры России» на платформе Цифрового гербария МГУ может каждый, загрузив фотографию и поставив точку съемки на карте.
2018 ГОД
[Начало на 0:02:14]
7 декабря 2018 г. в Кремле вручали премии Русского географического общества. В торжественной церемонии принял участие президент России Владимир Путин. Среди лауреатов - Цифровой гербарий МГУ под руководством А.П. Серегина.
От "Цифрового гербария МГУ" к "Атласу флоры России": новости культуры (10.07.2018). Из гербария реального - в гербарий цифровой. В МГУ создают одну из самых больших электронных баз растений. Работа еще не завершена, но уже сейчас доступ к ресурсу может получить любой желающий. О растениях в сети в репортаже Анастасии Егоровой. Ученые и программисты сейчас работают еще над одним проектом - электронным атласом растений. Это виртуальная карта, которая наглядно покажет, какие виды трав растут в разных уголках Земли. Атлас создаётся на базе гербария. А его коллекция постоянно растёт. Стеллажи МГУ уже заполнены доверху. А на виртуальных полках всегда найдется место. Оцифровку крупнейшей коллекции засушенных растений закончат осенью.
Эфир передачи "Черные дыры. Белые пятна" (4.07.2018) на телеканале "Культура". О чем расскажет гербарий и зачем извлекать ДНК у растений, собранных 300 лет назад. Спикер выпуска: Алексей Серегин, ведущий научный сотрудник Гербария биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова.
2017 ГОД
Видеодоклад на Межрегиональной научной конференции «Актуальные вопросы изучения растительного покрова Южного Нечерноземья России» (г. Брянск, 26 октября 2017 г.). Семь минут про то, что сейчас представляет Цифровой гербарий МГУ.
Проект «Ноев ковчег» МГУ, поддержанный РНФ, презентовал промежуточные результаты работы (6.10.2017). Более 200 новых описанных видов животных, 10 созданных лабораторий и около 700 опубликованных научных статей. Презентация результатов научного проекта МГУ имени М.В. Ломоносова по созданию национального банка-депозитария живых систем «Ноев ковчег», поддержанного крупным грантом РНФ, прошла 6 октября в Фундаментальной библиотеке МГУ.
А.П. Серегин: "В традиционном для таких встреч ключе я остановлюсь на трех основных сюжетах – кратко расскажу о создании новых лабораторий и коллекций, остановлюсь на нескольких прорывных научных результатах и, наконец, вкратце изложу историю того, как за два с половиной года мы создали Цифровой гербарий МГУ – крупнейшую в России базу данных по биоразнообразию".
Цифровой гербарий МГУ. Утро России. Эфир от 31.01.2017. Процесс сканирования гербария благодаря усилиям "России 1" попал на камеру. Съемки проходили не только в Гербарии МГУ, но и на производственной площадке корпорации "ЭЛАР". О создании Электронного гербария МГУ репортаж Андрея Негру (съемки 26.01.2017)
Цифровой гербарий МГУ - ТВЦ (съемки 24.01.2017). Во вторник съемочная группа "ТВ Центр" отсняла сюжет о работе Гербария МГУ. С места событий - репортаж Юлии Богоманшиной.
Гербарий МГУ в новостях канала "Культура" (съемки от 16.01.2017). Всё о флоре теперь можно узнать из проверенных источников. В Московском государственном университете заработал один из крупнейших в мире цифровых гербариев. Коллекция отсканированных образцов, хранящихся в фондах биологического факультета, теперь выложена в открытом доступе. Гербарий МГУ – один из ведущих центров изучения и документации растений. Созданный в середине XVIII века сегодня он представляет собой собрание мирового значения. А его электронная версия постоянно пополняется новыми экземплярами. Репортаж Анастасии Егоровой.
2016 ГОД
По гербарной надобности Петровича позвали на НТВ в передачу "Студия Юлии Высоцкой". Готовить яичницу на камеру я не буду, а вот про гербарий немножко расскажу в непринужденной обстановке за яблочным пирогом и чашкой чая. В эфир программа вышла 9 сентября 2017 года в 8 утра. О проекте. Познавательная программа, рассказывающая об образе жизни. Полчаса позитивного настроения, практических советов и готовых решений. В своей уютной студии Юлия Высоцкая не только приготовит завтрак, но и вместе с приглашенными экспертами и друзьями даст практические советы и предложит решения многих семейных и бытовых проблем. Программа станет своеобразным навигатором для женщин, который поможет им найти ориентир в быстро меняющемся современном мире.
Гербарий Московского университета (MW) – коллекция мирового значения с ярко выраженной специализацией на флоре России. Фонды насчитывают на 1 января 2016 г. 982 700 образцов, в т.ч. 4 555 типовых образцов и несколько уникальных старинных коллекций. Это второй по величине гербарий в России. В рамках комплексной программы “Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем” (грант РНФ № 14-50-00029) по направлению «Растения» (рук. А.П. Серёгин) гербарий МГУ получил финансирование на оцифровку коллекций. Информационно-аналитическая система (ИАС) Депозитария биоматериала Биоресурсного Центра МГУ создана с целью обеспечение функционирования и поддержки единого информационного пространства для каталогизации образцов биологического материала в коллекциях депозитария и других организациях, представивших данные о материале своих коллекций.
2012 ГОД
По-видимому, первое видео на YouTube.
ПОДКАСТ РАДИО ЗВЕЗДА (июнь 2022 г.)
Соревнования и челленджи для биологов-непрофессионалов. Лекция биолога Алексея Серёгина. В последние годы соревнования по документации биологического разнообразия стали сверхпопулярными. Каждый, у кого есть смартфон и пара дней, может принять участие в различных соревнованиях и биоблицах. Например, кто найдёт больше видов птиц за четверо суток? Рассказывает ведущий сотрудник биофака МГУ, доктор биологических наук - Алексей Серёгин.
Как менялись русские пейзажи с развитием цивилизации? Лекция биолога Алексея Серёгина. Регулярные ботанические исследования флоры Средней России начались около 200 лет назад. Уже во второй половине 19 века описательная флористика достигла своего расцвета – сотни отдельных урочищ и сообществ были досконально описаны учёными, а образцы аккуратно собраны в гербарий. Спустя сто лет мы можем пройтись теми же маршрутами и понять, что изменилось вокруг нас. Рассказывает ведущий сотрудник биофака МГУ, доктор биологических наук - Алексей Серёгин.
Новая жизнь сухих растений. Лекция биолога Алексея Серёгина. С момента изобретения гербария учёные разных стран собрали 400 миллионов гербарных образцов растений, водорослей и грибов. Как и где хранят гербарий? Как цифровые технологии помогают учёным всего мира? Почему ботаники-полиглоты? И как любой из вас может помочь науке? Рассказывает ведущий сотрудник биофака МГУ, доктор биологических наук - Алексей Серёгин.
Где в России можно увидеть самые необычные растения? Лекция биолога Алексея Серёгина. Самая большая страна в мире протянулась на тысячи километров от полярных льдов до бесплодных пустынь, поражая разнообразием ландшафтов и живой природы. Учёные десятилетиями описывали флоры отдельных пунктов страны – заповедников, островов, гор, таёжных рек, степных балок. Постепенно на карте России появилось две тысячи точек, досконально изученных ботаниками. Где в России можно увидеть самые необычные растения? Рассказывает ведущий сотрудник биофака МГУ, доктор биологических наук - Алексей Серёгин.
Как формировалась и менялась флора Москвы. Лекция биолога Алексея Серёгина. Огромный мегаполис обладает уникальным сочетанием природных территорий, сплошной городской застройки и окультуренных ландшафтов. Его флора насчитывает две тысячи видов, каждый из которых проникал сюда своей дорогой. Какие-то растения продолжают существовать здесь с момента отступления последнего ледника, а какие-то были случайно занесены мощными ветрами лишь в прошлом году. Учёные уже двести лет изучают флору Москвы, а в последние годы к ним присоединилось свыше трёх тысяч волонтёров. Как "сбегают" и "переезжают" растения? Чем железные дороги интересны ботанику? Откуда взялась в Москве омела? Рассказывает ведущий сотрудник биофака МГУ, доктор биологических наук - Алексей Серёгин.
"ПОЛЕВАЯ БИОЛОГИЯ ДЛЯ НЕБИОЛОГА" (ОСЕННИЙ СЕМЕСТР 2021/22)
Лекция № 1. Введение. «Большие данные» о биоразнообразии.
Лекция № 2. Знакомство с платформой iNaturalist.
Лекция № 3. «Наблюдение» как основа массива данных. Геоданные. Как снимать, что снимать?
Лекция № 4. Искусственный интеллект iNaturalist. Ошибки: что не надо делать на iNaturalist?
Лекция № 7. Практические примеры применения платформы iNaturalist. Разбор домашнего задания
Лекция № 8. Определение видов: искусственный интеллект и таксономическая экспертиза изображений
Лекция № 9. Биоблицы, геймификация и другие варианты интересной активности на платформе iNaturalist
Лекция № 10. Что учёные узнали нового о флоре России за последние три года благодаря iNaturalist?
Лекция № 11. Что ученые узнали нового о флоре России за три года благодаря iNaturalist?
"ПОЛЕВАЯ БИОЛОГИЯ ДЛЯ НЕБИОЛОГА" (ВЕСЕННИЙ СЕМЕСТР 2021/22)
Лекция 1. Введение: немного о курсе. "Большие данные" о биоразнообразии
Лекция 3. "Наблюдение" как основа массива данных. Геоданные. Что и когда снимать?
Лекция 4. Искусственный интеллект iNaturalist. Компьютерное зрение. Глубокое обучение
Лекция 5. Определение видов: искусственный интеллект и таксономическая экспертиза изображений.
Лекция 6. Проекты в iNaturalist. Биоблицы: чемпионаты по документации биоразнообразия.
Лекция 9. Что ученые узнали нового о флоре России за последние 3 года благодаря iNaturalist?
Не забудьте ознакомиться с текущими новостями в конце поста - там снова несколько обновлений.
На счётчике сегодня новая круглая отсечка: 2 420 000 наблюдений в проекте "Флора России"! Для очередных 10 тыс. наблюдений нашему сообществу потребовалось всего 6 дней (в прошлый раз на 10 тысяч ушло 4 дня). За последние 6 дней число наблюдателей флоры России выросло на 68 новичков, а число выявленных и подтверждённых видов выросло на 7 таксонов в условиях активной чистки номенклатуры. В середине февраля мы преодолели отметку в 8000 видов.
We've got another milestone on the counter - 2,420,000 observations in the "Flora of Russia" project! For the 10-thousandth mark, our community spent 6 days (comparing to 4 days for previous 10K). During these days, the number of observers of the flora of Russia increased by 68 folks. We've got seven new identified and confirmed species in line with an active cleaning of nomenclature. We passed the milestone of 8,000 species in mid-February.
За последние 6 суток сразу 448 человек из 21,7 тыс. наблюдателей смогли выйти на улицу, сделать хотя бы одно наблюдение в природе и загрузить его на iNaturalist. В этот раз доля свежих полевых наблюдений составила 30% (против 70%, поступивших из архивов пользователей или вытащенных экспертами из бэклога). Несмотря на наступление весны, большинство наблюдений всё же пока идут из архивов.
Over the past 6 days, 448 people have been able to go outside, make at least a single observation in nature and upload it to iNaturalist. This time, the share of fresh field observations was 30% versus 70% that came from archives or pulled by the experts from the backlog.
Давайте снова зафиксируем статистику для истории.
2 420 000 наблюдений наш проект достиг 8 апреля 2023 г. около 22:00 MSK.
The project reached 2,420,000 observations in April 8, 2023 at about 22:00 MSK.
С прошлого замера проект вырос на 10,1 тыс. наблюдений, а антипроект снова сократился - в этот раз на 3,3 тыс. наблюдений. На сегодняшний день доля неопределенных материалов по флоре России упала до 13,13% (в прошлый раз было 13,28%). Мы ежегодно отмечаем сокращение завалов примерно до конца апреля. Так что пока продолжается то время, когда стоит загружать летние и прошлогодние архивы! Судя по статистике, именно архивы сейчас питают наш проект. Интересно, что мы уже заметно преодолели прошлогодний минимум бэклога (13,44%) и уверенно продолжаем целенаправленно сокращать завалы.
Как и прежде мы благодарны всем, кто ставит галочку "В культуре" для снятых культивируемых растений. Пожалуйста, прочитайте специальный релиз, посвященный загрузке 100 000-го наблюдения культурной флоры России. На днях мы преодолели отсечку в 150 000!
2) Региональные проекты "Флоры России" очень разные по числу наблюдений, участников и подписчиков. Собственно, именно они в сумме и составляют данные основного проекта. На главной странице зонтичного проекта можно посмотреть региональный зачёт по числу фотонаблюдений, видов и наблюдателей.
3) Антипроект (бэклог) "Флоры России" включает неопределённые и неверифицированные наблюдения и является важнейшей точкой входа для наших экспертов. Бэклог составляет свыше 420 000 наблюдений после активного сезона, но с осени постепенно сдувается. Это обычный ход вещей: как правило, число наблюдений в нём сокращается с сентября по апрель и растёт в тёплое время года.
4) Большая "Флора России" включает как определённые, так и неверифицированные наблюдения. Она нужна для оценки общего состояния данных по флоре России, загруженных пользователями. Например, здесь удобно смотреть, какова доля неопределенных наблюдений. Это плоский проект без региональной структуры.
5) "Серая зона" включает наблюдения культурных растений и забракованные данные, т.е. наблюдения, не отвечающие формальным критериям качества. Мы благодарны всем, кто ставит галочку "Культурное" для снятых культивируемых растений.
6) Потеряшки "Флоры России" - это такой небольшой проект, который включает около 300-500 определённых и верифицированных наблюдений, которые случайно не попали в региональные порталы. Это происходит из-за: (1) слишком большого радиуса привязки наблюдений, (2) несовершенства шейп-файлов регионов, (3) намеренного искажения или загрубления координат или радиусов, (4) привязки к административным единицам, а не к конкретным точкам.
7) И, наконец, у нас есть копилка "Флоры России". Её история такова: ещё в 2021 г. вышла очередная новая модель автоматического распознавания видов iNaturalist. Для того, чтобы привлечь внимание сообщества к видам, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель, мы и запустили копилку. В ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. Виды в копилке постоянно обновляются - мы исключаем из неё виды, преодолевшие пороговую отметку и добавляем новые.
Приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону". В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения.
Традиционные таблички даны ниже.
1. Самые активные участники (число наблюдений) | Top-observers (number of observations)
● В конце апреля нас ждёт City Nature Challenge. Все подробности здесь. Кто хочет привезти CNC в свой город - становитесь админами городских проектов! Всё просто: хотите большой движухи? Конкурсы, соревнования, биоблицы? Командный кубок? Личный кубок? Белые пятна? Пройдите наш опрос. Форма для опроса будет доступна до 15 апреля.
● Лекторий "Флоры России" - главное событие этой весны! Вас ждёт 16 лекций от ведущих ботаников страны. Лекции проходят онлайн по пятницам или субботам. Обязательно приходите на прямые эфиры! На этой неделе нас ждёт уже десятая лекция. А здесь наш канал в YouTube, на который обязательно стоит подписаться!
● Научно-популярный канал "Осины с апельсином" - это короткие ведеоистории по ключевым ботаническим вопросам для участников проекта "Флора России". Автор цикла - Ксения Дудова (@antennaria). Обязательно подписывайтесь на наш апельсиновый канал в YouTube. Восемь видео готово, ждём новые! Еще у нас есть полноценные лекции для новичков iNaturalist на нашем канале "Полевая биология для небиолога".
● Снова вышла новая модель автоматического распознавания видов. Теперь модель дополняется новыми видами ежемесячно! Мы снова обновили копилку "Флоры России" - в ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. Присоединяйтесь! Каждая модель становится всё более и более компетентной. Все подробности здесь?: и про отбор видов, и про личное участие в обучении моделей.
● Опубликованы очередные истории из цикла "Перераспределение усилий" 2023 года. Мы охватили 37 регионов и дошли до Красноярского края (здесь же есть все ссылки на публикации цикла). Автор карт - Ярослав Магазов (@yaroslavmagazov). Двигаемся согласно рейтингу, и до вашего региона тоже доберемся - всему своё время!
● Опубликован второй релиз карт "Атласа флоры России". Мы подробно рассказали об этом важном событии. Каждая сеточная карта по квадратам 100×100 км на 8793 видов сделана на основе датасета FLORUS. Работа над чисткой карт продолжается.
● Цифровой гербарий МГУ запустил большую новую платформу для онлайн-волонтёров помогатор. Онлайн-лекция о Гербарии МГУ и помогаторе доступна в записи.
● Проект "Флора России" на iNaturalist теперь официально зарегистрирован на платформе dobro.ru в качестве волонтёрского проекта. Это платформа, на которой ведётся учёт российских волонтёрских инициатив, в том числе программ научного волонтёрства. Пожалуйста, подпишитесь на нас на этой странице, используя учётку с Госуслуг. Это будет очень полезно для дальнейшей спокойной работы iNaturalist в России.
Для написания данного поста использован конвертер текстовых и табличных данных, который осуществляет разметку текста. Конвертер разработал Константин Романов (@kildor). Если у вас есть свои проекты, то вам эта ссылка, уверен, пригодится!
🌳🍊 Мы продолжаем наш образовательный канал на YouTube "Осины с Апельсином"! Здесь мы размещаем наши краткие видео-уроки (от 15 до 30 минут) по разным разделам ботаники. Морфология, фитоценология, география растений и другие. Автор цикла - Ксения Дудова (@antennaria).
🌷 Тюльпаны, рябчики, птицемлечники и редкие виды бельвалий - в этом видео мы рассказываем о самых ярких и распространенных первоцветах степей. Вы узнаете, почему они цветут раньше других растений, причины редкости этих видов и другие факты о них. Об этом и многом другом в новом выпуске канала «Осины с Апельсином».
Не забудьте ознакомиться с текущими новостями в конце поста - там снова несколько обновлений.
На счётчике сегодня новая круглая отсечка: 2 430 000 наблюдений в проекте "Флора России"! Для очередных 10 тыс. наблюдений нашему сообществу потребовалось 6 дней (в прошлый раз на 10 тысяч ушло 6 дней). За последние 6 дней число наблюдателей флоры России выросло на 81 новичка, а число выявленных и подтверждённых видов выросло на 3 таксона в условиях активной чистки номенклатуры. В середине февраля мы преодолели отметку в 8000 видов.
We've got another milestone on the counter - 2,430,000 observations in the "Flora of Russia" project! For the 10-thousandth mark, our community spent 6 days (comparing to 6 days for previous 10K). During these days, the number of observers of the flora of Russia increased by 81 folks. We've got three new identified and confirmed species in line with an active cleaning of nomenclature. We passed the milestone of 8,000 species in mid-February.
За последние 6 суток сразу 575 человек из 21,8 тыс. наблюдателей смогли выйти на улицу, сделать хотя бы одно наблюдение в природе и загрузить его на iNaturalist. В этот раз доля свежих полевых наблюдений составила 45% (против 55%, поступивших из архивов пользователей или вытащенных экспертами из бэклога). Свежие наблюдения и архивы почти сравнялись.
Over the past 6 days, 575 people have been able to go outside, make at least a single observation in nature and upload it to iNaturalist. This time, the share of fresh field observations was 45% versus 55% that came from archives or pulled by the experts from the backlog.
Давайте снова зафиксируем статистику для истории.
2 430 000 наблюдений наш проект достиг 15 апреля 2023 г. в 05:55 MSK.
The project reached 2,430,000 observations in April 15, 2023 at 05:55 MSK.
С прошлого замера проект вырос на 9,8 тыс. наблюдений, а антипроект снова сократился - в этот раз на 1,9 тыс. наблюдений. На сегодняшний день доля неопределенных материалов по флоре России упала до 13,02% (в прошлый раз было 13,13%). Мы ежегодно отмечаем сокращение завалов примерно до конца апреля. Так что пока продолжается то время, когда стоит загружать летние и прошлогодние архивы! Интересно, что мы уже заметно преодолели прошлогодний минимум бэклога (13,44%) и уверенно продолжаем целенаправленно сокращать завалы.
Как и прежде мы благодарны всем, кто ставит галочку "В культуре" для снятых культивируемых растений. Пожалуйста, прочитайте специальный релиз, посвященный загрузке 100 000-го наблюдения культурной флоры России. На днях мы преодолели отсечку в 150 000!
2) Региональные проекты "Флоры России" очень разные по числу наблюдений, участников и подписчиков. Собственно, именно они в сумме и составляют данные основного проекта. На главной странице зонтичного проекта можно посмотреть региональный зачёт по числу фотонаблюдений, видов и наблюдателей.
3) Антипроект (бэклог) "Флоры России" включает неопределённые и неверифицированные наблюдения и является важнейшей точкой входа для наших экспертов. Бэклог составляет свыше 420 000 наблюдений после активного сезона, но с осени постепенно сдувается. Это обычный ход вещей: как правило, число наблюдений в нём сокращается с сентября по апрель и растёт в тёплое время года.
4) Большая "Флора России" включает как определённые, так и неверифицированные наблюдения. Она нужна для оценки общего состояния данных по флоре России, загруженных пользователями. Например, здесь удобно смотреть, какова доля неопределенных наблюдений. Это плоский проект без региональной структуры.
5) "Серая зона" включает наблюдения культурных растений и забракованные данные, т.е. наблюдения, не отвечающие формальным критериям качества. Мы благодарны всем, кто ставит галочку "Культурное" для снятых культивируемых растений.
6) Потеряшки "Флоры России" - это такой небольшой проект, который включает около 300-500 определённых и верифицированных наблюдений, которые случайно не попали в региональные порталы. Это происходит из-за: (1) слишком большого радиуса привязки наблюдений, (2) несовершенства шейп-файлов регионов, (3) намеренного искажения или загрубления координат или радиусов, (4) привязки к административным единицам, а не к конкретным точкам.
7) И, наконец, у нас есть копилка "Флоры России". Её история такова: ещё в 2021 г. вышла очередная новая модель автоматического распознавания видов iNaturalist. Для того, чтобы привлечь внимание сообщества к видам, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель, мы и запустили копилку. В ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. Виды в копилке постоянно обновляются - мы исключаем из неё виды, преодолевшие пороговую отметку и добавляем новые.
Приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону". В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения.
Традиционные таблички даны ниже.
1. Самые активные участники (число наблюдений) | Top-observers (number of observations)
● С 12 апреля 2023 г. в Крыму и Севастополе у местных провайдеров проводного интернета стали недоступны гуглокарты, встроенные в iNaturalist. Из-за этого не отображается геолокация ранее загруженных наблюдений и поиск по наблюдениям. Загрузка новых наблюдений работает нестабильно и только в том случае, если координаты места съемки зашиты в метаданные фотографий. Руководство iNaturalist сообщило, что они не производили каких-либо блокировок. По-видимому, либо поставщик контента (компания Google) блокирует часть своих сервисов в Крыму, либо местные провайдеры. Скорее всего, дело именно во внешнем ограничении доступа к гуглокартам - для крымчан отсутствие доступа к некоторым сайтам это давно обычное дело. В любом случае, (не)полноценный доступ к iNaturalist в Крыму пока возможен только через мобильный интернет (что дорого и неудобно) или через VPN (что медленно).
● В конце апреля нас ждёт City Nature Challenge. Все подробности здесь. Кто хочет привезти CNC в свой город - становитесь админами городских проектов! Всё просто: хотите большой движухи? Конкурсы, соревнования, биоблицы? Командный кубок? Личный кубок? Белые пятна? Пройдите наш опрос. Форма для опроса будет доступна до 16 апреля.
● Лекторий "Флоры России" - главное событие этой весны! Вас ждёт 16 лекций от ведущих ботаников страны. Лекции проходят онлайн по пятницам или субботам. Обязательно приходите на прямые эфиры! На этой неделе нас ждёт уже десятая лекция. А здесь наш канал в YouTube, на который обязательно стоит подписаться!
● Научно-популярный канал "Осины с апельсином" - это короткие ведеоистории по ключевым ботаническим вопросам для участников проекта "Флора России". Автор цикла - Ксения Дудова (@antennaria). Обязательно подписывайтесь на наш апельсиновый канал в YouTube. Девять видео готово, ждём новые! Еще у нас есть полноценные лекции для новичков iNaturalist на нашем канале "Полевая биология для небиолога".
● Снова вышла новая модель автоматического распознавания видов. Теперь модель дополняется новыми видами ежемесячно! Мы снова обновили копилку "Флоры России" - в ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. Присоединяйтесь! Каждая модель становится всё более и более компетентной. Все подробности здесь?: и про отбор видов, и про личное участие в обучении моделей.
● Опубликованы очередные истории из цикла "Перераспределение усилий" 2023 года. Мы охватили 37 регионов и дошли до Красноярского края (здесь же есть все ссылки на публикации цикла). Автор карт - Ярослав Магазов (@yaroslavmagazov). Двигаемся согласно рейтингу, и до вашего региона тоже доберемся - всему своё время!
● Опубликован второй релиз карт "Атласа флоры России". Мы подробно рассказали об этом важном событии. Каждая сеточная карта по квадратам 100×100 км на 8793 видов сделана на основе датасета FLORUS. Работа над чисткой карт продолжается.
● Цифровой гербарий МГУ запустил большую новую платформу для онлайн-волонтёров помогатор. Онлайн-лекция о Гербарии МГУ и помогаторе доступна в записи.
● Проект "Флора России" на iNaturalist теперь официально зарегистрирован на платформе dobro.ru в качестве волонтёрского проекта. Это платформа, на которой ведётся учёт российских волонтёрских инициатив, в том числе программ научного волонтёрства. Пожалуйста, подпишитесь на нас на этой странице, используя учётку с Госуслуг. Это будет очень полезно для дальнейшей спокойной работы iNaturalist в России.
Для написания данного поста использован конвертер текстовых и табличных данных, который осуществляет разметку текста. Конвертер разработал Константин Романов (@kildor). Если у вас есть свои проекты, то вам эта ссылка, уверен, пригодится!
🌳🍊 Мы продолжаем наш образовательный канал на YouTube "Осины с Апельсином"! Здесь мы размещаем наши краткие видео-уроки (от 15 до 30 минут) по разным разделам ботаники. Морфология, фитоценология, география растений и другие. Автор цикла - Ксения Дудова (@antennaria).
🌷 🌳🌱 В новом ролике на канале 🌳🍊 "Осины с апельсином" мы разбираем основные жизненные формы растений умеренного климата: их особенности, различия, примеры. Очень полезно для работы со специализированной литературой, чтобы с легкостью понимать слова вроде «гемикриптофит» и сокращений «пкуст.» 👌Об этом и многом другом в новом выпуске канала «Осины с Апельсином».
City Nature Challenge проводится на платформе iNaturalist. У участника челленджа должен быть опыт использования приложения iNaturalist, приложения Seek или сайта iNaturalist. К наблюдениям предъявляются стандартные требования платформы. В зачёт идут все группы живых организмов (животные, растения, грибы и проч.).
"Наблюдение" - это фотография (или группа фотографий) одного вида, сделанная в одно время в одном месте. Например, два фото одного и того же дерева - это одно наблюдение. Два фото двух разных деревьев - это два разных наблюдения. Два фото одного дерева, сделанные в разные дни - это два разных наблюдения. "Наблюдением" может быть также аудиофайл с записью птичьего голоса.
Не следует загружать в одно наблюдение фотографии разных видов. Если на одном фото два разных организма (например, цветок и бабочка), его нужно загрузить дважды как два разных наблюдения.
Не следует снимать домашних животных и культурные растения. Цель соревнований - в выявлении дикой природы городских и пригородных территорий. В случае загрузки таких видов (например, фото собаки, тюльпана с клумбы, дерева из регулярного городского озеленения, фикуса с окна и проч.), обязательно следует проставить галочку в поле "Культурное/В неволе". Таково требование платформы.
Фотографии должны быть сделаны вами лично в дни соревнований. Место и время съемки, как правило, сохраняется не только в паспорте наблюдения, но и в exif-файлах фотографий и доступны для контроля всем пользователям.
Можно загружать фото любых организмов, даже если вы не знаете их названия. В этом случае можно воспользоваться подсказкой искусственного интеллекта или выбрать "Растения", "Птицы", "Насекомые", "Грибы" или другую крупную категорию. В зачёт идут как верифицированные экспертами наблюдения ("исследовательского уровня"), так и неверифицированные ("требуется идентификация").
Челлендж проводится по правилам биоблица, т.е. с лимитом времени. Фотографировать можно четыре дня с 00:00 28 апреля по 23:59 1 мая 2023 г. по местному времени. Загружать фото можно как в дни съемки, так и в течение 6 дней после этого (до 23:59 7 мая 2023 г. по местному времени). Это сделано специально для того, чтобы не отвлекать активных участников от интенсивных полевых наблюдений.
Екатеринбург участвует в официальном мировом зачёте; остальные города - только в неофициальном российском зачёте (список уточняется, они будут отмечены пометкой "вне зачёта"). Статистика соревнований по России позволяет определить города-лидеры в категории "Число наблюдений", "Число видов", "Число наблюдателей". Личный зачёт в России по числу наблюдений и по числу видов будет проводиться как по отдельным городам, так и на общероссийском уровне.
Окончательный список городов-участников российского зачёта можно посмотреть на табло проекта. Если вы находитесь в городе, который не является участником или в сельской местности, то вы можете выступать за сборную России.
Чтобы наблюдения из неофициального российского зачёта всё же попали в международный проект, нужно подписаться на экстерриториальную страничку (создана для участников, города которых участвуют вне зачёта или не участвуют вовсе). Такие наблюдения попадут в общий CNC через личный зачёт.